La tercera temporada de 24 a sido una de las mejores. Despues de que la segunda temporada siguiera manteniendo el exito de la serie, ahora los productores de 24 tenian que sorprendernos con algo mucho mejor a lo mostrado, y el resultado fue el esperado.
Al igual que en las anteriores temporadas, se ven muchas caras nuevas en el elenco, destaca a James Bagde Dale, un nuevo agente de campo de CTU y el ayudante de Jack. Mary Lynn Rajskub se intengra en el papel de Chloe O'Brian, una anlista de CTU, que tiene un caracter muy apatico y arisco. Y se mantiene personajes caracterizticos como Jack, Tony, Michelle, Chapelle, Palmer entre otros. La historia sigue mateniendo a millones de vidas en peligro, pero esta ves el enemigo es otro.
Despues de que Jack lograra demostrar que la guerra era un error, se encuentra en CTU dirigiendo en conjunto con Tony Almeida. Tony esta casado con Michelle. Kim ahora trabaja con su padre en CTU y tiene un romance con Chasse. Palmer sigue siendo presidente, y su hermano toma el rol que tenia Novick. Pero la amenaza ahora es otra. Un maniatico pretende soltar un virus letal y sin cura, Jack y Tony tienen que dar lo mejor para detenerlo.
Sin duda esta temporada es grandiosa y aqui 24 se consolida como la serie mas revolucionaria de los ultimos tiempos.
Jack vuelve a CTU y trabaja en un doble mando con Tony Almeida, casado con Michelle Desller. Kim trabaja en CTU con su padre. Este le consigui trabajo ahi para tenerla cerca y que no le pasaran mas cosas malas. Jack tiene un ayudante, Chasse Edmunds, que tiene un romance con Kim y el cual lo ayudo a meter a la carcel a un traficante de drogas de alto rango. Pero Jack tiene un problema, para poder infiltrarse en la banda tuvo que volverse adicto a las drogas.
Hay una nueva amenaza. Alguien planea expandir un virus mortal por todo EE.UU y Jack quiere detenerlo. Tony y Jack tratn de localizar al joven que expandira el virus, lo que conyeba a Tony a un balazo en el cuello y a una hospitalizacion segura.
Jack para poder llegar a el virus tiene que soltar a el traficante, Ramon Salazar, aunque esto significara que lo trataran como traidor. En el acto armo un alboroto en la carcel. Chasse queria hacer entender a Jack que lo que hacia estaba mal. Pero Jack logra escaparse con Ramon, y Chasse no quiere quedarse asi por lo que sigui a Jack a su destino. El Presidente Palmer tiene elecciones. Lo cual le quita tiempo en tratar el tema del virus.
Jack llega a destino y se encuentra con el hermano de Ramon. Estos tenian un trato, Jack sacaba a Ramon y ellos hacian un negocio. Todo estaba planeado, Jack y Tony hicieron creer que habia un virus para que Jack liberara a Ramon y este hiciera un negocio de comprar el verdadero virus. Este plan era secreto, ni el presidente lo sabia.
Jack llega al lugar y convence a Ramon a llevar a cabo el negocio, pero Jack no sospechaba que Chasse lo siguio y lo capturaron. Jack para seguir con la mision no tuvo otra cosa mas que entregarlo.
Jack le pide ayuda a la esposa de Hector, hermano de Ramon para liberar a Chasse. Ella tuvo un romance con Jack lo cual sirvio para convencerla a ayudar. Logro sacar a Chasse pero murio en el acto.
Chasse coopera con Jack y este se da cuanta que habia otro comprador, Nina Myers. Jack quiere convencer a Nina de que juntos compren el virus, pero esta no concedio y Jack tuvo que usar la fuerza para que cooperara. En el momento de intercambio, Amador logra escapar y la unica fuente de informacion era Nina, todo el plan habia fracasado. Nina dice todo lo que sabe, y Jack aprovecha el momento para asesinarla. Jack por fin se habia vengado de la muerte de su esposa.
Palmer tiene problemas. Su hermano tuvo un romance con la mujer de un financiador de la presidencia Palmer. Sherry decide ayudar, pero en el acto mata al financiador y Palmer trata de tapar todo para no verse involucrado. Jack logra dar con el hombre que esta detras de el virus. Se llama Stephen Saunders y era compañero de Jack en el atentado a Victor Drazen, pero este lo abandono por lo que Stephen tiene mucha sed de venganza.
Saunders ataca un edificio expandiendo el virus y demostrando de que habla enserio. Michelle, la esposa de Tony que trabaja en CTU la envian a formar parte del caso, aun asi sabiendo que se expondria al virus.
Antes de que Saunder planee su segundo ataque, Jack logra dar con el y tambien tiene a su hija y la usa para que se entregue, pero se le escapa, ¿por que?. Han raptado a Michelle y Saunders obliga a Tony a ayudarlo a escapar o si no la mata. Tony decide ayudar, aun asi sabiendo que estaria arriesgando a todo un pais. Jack se entera de que Tony dio la orden y este escapa con la hija de Saunders para cambiarla por Michelle. Pero Jack lo atrapa antes y lo obliga ayudar para atrapar a Saunders. Tony no muy convencido con la idea no le queda otra que ayudar. Engañan a Saunders tratando de hacer el cambio y lo logran atrapar.
Keller, el otro candidato a la presidencia se entera atraves de Sherry de lo que paso con la muerte de el ayudante de Palmer y intenta hacer chantaje. El hermano de Palmer intenta tapar las pruebas, pero en el acto muere Sherry y el amor de el hermano de Palmer. Palmer atrofiado con todo lo que a pasado decide retirarse de la candidatura. Saunder habla y dice que hay varias celulas expandiendo el virus. Encuetran a todas las celulas pero falta una.

Jack y Chasse lo logran localizar y lo persiguen. Chasse lo encuentra y le quita el virus, pero se lo amarro a el brazo para que el terrorista no se lo llevara. El terrorista iba a matar a Chasse cuando llega Jacky lo salva. Queda poco tiempo y la unica salida es cortarle el brazo a Chasse, ya que la correa de metal era muy fuerte. Chasse dice a Jack que lo haga, este lo hace y introduce el virus en un frezzer. La capsula del virus explota quedandose en el interior. A Chasse lo llevan de urgencia al hospital.
A Tony lo toman detenido por traicion y le esperan 20 años en la carcel. Jack decide rehabilitarse en su adiccion.